长期浸泡在水体中的网具因大量附着藻类生物或其它杂物而堵塞网目，造成网箱的滤水清洗方法，可有效除去阻塞杂物，保持网目水流畅通。
钙粉涂抹法 围箱网具使用前，在网具上涂附一层碳酸钙粉或其它钙化合成物，能增强网具的柔软性能，从而使油污物不易附着。为了使碳酸钙粉末与网线充分凝固，可用聚氯乙烯、聚酰胺、橡胶等作为粘合剂。使用时，先在网上附上粘合剂，然后加碳酸钙粉末（或将两者混合后）再涂于网上。按此法处理的网具不仅经久耐用，且防堵性能良好。
生物防堵法 在网箱中放入一些刮食性鱼类，如鲻鱼、鲷鱼或尼罗罗非鱼，这样，放入的刮食性鱼类可以通过吃附着的藻类和某些低等无脊椎动物清除网目。
增大网目法 在网箱养鱼中，适当增大网目能够增强网箱的滤水量。如鲢、鳙的夏花鱼种，在网孔为1厘米的网箱中很容易阻塞网孔，若网孔增大到1．5厘米时，就可以大大提高网孔的滤水性能。需要注意的是，增大网目后必须相应地提高夏花鱼种的规格，切实做到鱼网恢恢，疏而不漏。
上提下沉法 上提或下沉网箱能大大减少网孔的堵塞现象。这是因为：大部分藻类附着在水面以下1米的范围内，因此，定期将网具上提曝晒，可将堵在网目上的藻类晒死。如网箱是封闭式或浮式网箱，则可将网箱沉入水下1米，也有利于疏通堵塞的网目。
高压冲洗法 使用时，只需一人提起网具，另一人用高压水枪冲洗即可。此法劳动强度低，并能加快清洗网具的速度。
